Как правильно оформить соглашение по отказу мужа от своей части квартиры в счет алиментов

Любой отказ от алиментов юридически ничтожен. А вот получить алименты в виде имущества — можно. 
Согласно семейного законодательства алименты могут уплачиваться:

в долях к заработку и (или) иному доходу лица, обязанного уплачивать алименты;

в твердой денежной сумме, уплачиваемой периодически;

в твердой денежной сумме, уплачиваемой единовременно;

путем предоставления имущества;
иными способами, относительно которых достигнуто соглашение.

В соглашении об уплате алиментов может быть предусмотрено сочетание различных способов уплаты алиментов.

Если доля супруга не выделена, то и распорядиться он ею не может. Сначала соглашением между вами надо выделить его долю, зарегистрировать соглашение в Росреестре, затем эту долю он может передать ребенку в счет уплаты алиментов. И этот договор тоже подлежит регистрации в Росреестре.